ОПТИМІЗАЦІЯ МЕТОДИКИ RAPD-АНАЛІЗУ ДЛЯ ДЕТЕКЦІЇ ПОЛІМОРФІЗМУ ПОСЛІДОВНОСТЕЙ ДНК У ЛІНІЙ КУКУРУДЗИ

Автор(и)

  • В. П. Доменюк Південний біотехнологічний центр у рослинництві УААН, Україна
  • Т. Г. Вербицька Південний біотехнологічний центр у рослинництві УААН, Україна
  • Ю. М. Сиволап Південний біотехнологічний центр у рослинництві УААН, Україна

Ключові слова:

RAPD-аналіз, поліморфізм ДНК, кодомінування, ПААГ

Анотація

Проведений RAPD-аналіз для виявлення поліморфних послідовностей ДНК генотипів вихідних форм сегрегуючої популяції кукурудзи (ГК 26 ґ Мої 7). Пропонується поліпшена методика електрофоретичного аналізу продуктів довільно праймованої ПЛР у поліакриламідному гелі (система RAPDПААГ) з оптимальним співвідношенням: час розбігу — якість виразності — вартість методики. Використання запропонованої системи дозволило встановити два типи успадкування поліморфних ампліконів генотипом гібриду — домінування і кодомінування. Виявлене успадкування алелів за кодомінантним типом передбачається використати для розрахунків зчеплення поліморфних фрагментів з ознаками продуктивності кукурудзи.

Посилання

  1. Williams J. G., Kublic A. R., Livak К. J., Rafalski J. A., Tingey S. V. DNA polimorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucleic Acids Res. — 1990. — V. 18. — P. 6531-6535.
  2. Martin G. B., Williams J. G., Tanksley S. D. Rapid identification of markers near a Pseudomonas resistance gene in tomato using random primers and near-isogenic line // Proc Natl Acad Sci USA. — 1991. — V. 80. — P. 2336-2340.
  3. Micheltnore R. W., Paran I., Kesseli R. И Identification of markers linked to disease-resistans genes by bulked segregant analysis. A rapid method to detect markers in specific genomic regions by using segregating populations // Proc Natl Acad Sci USA. — 1991. — V. 88. — P. 9828-9832.
  4. Reiter R. S., Williams J., Feldman K., Rafalski J. A., Tingey S. V., Scolnik R. S. Global and local genome mapping in Arabidopsis thaliana by using recombinant inbred lines and random amplified polimorphic DNAs // Proc Natl Acad Sci USA. — 1992. — V. 89. — P. 1477-1481.
  5. Сиволап Ю. М. Геном рослин та його поліпшення. — К.: Урожай, 1994. — С. 163-166.
  6. Lander Е. S., Green Р., Abrahamson J., Barlow A., Daly М. J., Lincoln S. Е., Newburg L. MAPMAKER: An interactive computer package for constructing primary genetic lineage maps of experimental and natural populations // Genomics. — 1987. — V. 1 — P. 174-181.
  7. Вербицкая T. Г., Сиволап Ю. M., Соколов В. M. Генетический полиморфизм линий кукурузы и его связь с продуктивностью // Актуальные проблемы биотехнологии в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии. Тезисы конференции. — Москва, 1996. — С. 15.
  8. Кожухова Н. Э., Вербицкая Т Г., Сиволап Ю. М. Исследование внутривидового полиморфизма кукурузы с помощью молекулярных маркеров // Актуальные проблемы биотехнологии в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии. Тезисы конференции. — Москва, 1996. — С. 40.
  9. Не S., Ohm H, Mackenzie S. Detection of sequence polymorphism among wheat varieties // Theor Appl Genet. — 1992. — V. 82. — P. 573-578.
  10. Riedel G. E., Swanberg S. L., Kuranda K. D., Marquette K, LaPan P., Bledsoe P., Kennedy A., Lin B. Y. Denaturing— gradient— gel electrophoresis identifies genomic DNA polimorphism with high frequency in maize // Theor Appl Genet. — 1990. — V. 80. — P. 1-10.
  11. Welsh J., McClelland M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers // Nucleic Acids Res. — 1990. — V. 18. — P. 6531 -6535.
  12. Abrams E. S.t Murdaugh S. E., Lerman L. S. Comprehensive detection ofsingl base changes in human genomic DNA using denaturing gradient gel electrophoresis and a GC-clamp // Genomics. — 1990. — V. 7. — P. 463-475.
  13. Fisher S. G., Lerman L. S. DNA fragments differing by singl base-pair substitution are separated in denaturing gradient gels: correspondence with melting theory // Proc Natl Acad Sci USA. — 1983.—V. 80. —P. 1579-1583.
  14. Myers R. M., Maniatis T, Lerman L. S. Detection and localisation ofsingl base changes by denatusing gradient gel electrophoresis fl Method Enzymol. — 1987. — V. 155. — P. 501-527.
  15. Burmeister M., diSibio G., Cox D. R., Myers R. M. Identification of polimorphisms by genomic denaturing-gradient-gel electrophoresis: application to the proximal region of human chromosome21 // Nucleic Acids Res. — 1991. — V. 19. —P. 1475-1481.
  16. Gray M., Charpentier A., Walsh K., Wu P., Bender W. Mapping point mutations in the Drosophila rosi locus using denaturing-gradient-gel blots // Genetics. — 1991. — V. 127. — P. 139-149.
  17. Lexwi E. P. Rapid surveying of DNA sequence variation in natural population // Mol. Biol Evol. — 1992. — V. 9. — P. 323-330.
  18. Kamalay I., Tepsant C., Rufener C. Isolation and analysis of genomic DNA from singl seeds //Crop Sci. — 1989. — №5. — P. 1079-1084.

##submission.downloads##

Опубліковано

2022-07-05

Як цитувати

Доменюк , В. П., Вербицька , Т. Г. ., & Сиволап , Ю. М. (2022). ОПТИМІЗАЦІЯ МЕТОДИКИ RAPD-АНАЛІЗУ ДЛЯ ДЕТЕКЦІЇ ПОЛІМОРФІЗМУ ПОСЛІДОВНОСТЕЙ ДНК У ЛІНІЙ КУКУРУДЗИ. Вісник Одеського національного університету. Біологія, 6(1), 51–58. вилучено із http://visbio.onu.edu.ua/article/view/260937

Номер

Том 6 № 1 (2001)

Розділ

ГЕНЕТИКА І МОЛЕКУЛЯРНА БІОЛОГІЯ

Ліцензія

Creative Commons License

Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:

  1. Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0).
  2. Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
  3. Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) роботи, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).

Публікація праць в Журналі здійснюється на некомерційній основі. Комісійна плата за оформлення статті не стягується.